Геннадий Викторович Бабочкин родился 9 декабря 1960 года в семье офицера. Русский.
В 1983 году окончил Хабаровский политехнический институт и получил квалификацию архитектора.
С 1983 по 1986 год работал в Хабаровске. Проектировал генеральные планы сельских населенных мест, поселков.
С 1986 года работал в Москве, в проектном институте "РосНИИагропром".
С апреля 1991 года по июнь 2008 года – в проектном институте ОАО "ЦНИИЭПжилых и общественных зданий". Под его руководством по индивидуальным проектам в Москве и в Подмосковье построено: 13 жилых домов, два промышленных здания, реконструировано одно здание — памятник архитектуры.
2008-2012 гг. - государственный эксперт-архитектор в государственном автономном учреждении "Московская государственная экспертиза".
26 июля 2012 - сентябрь 2014 гг. - руководитель муниципалитета внутригородского муниципального образования Пресненское.
В 2022 г. - главный архитектор проектов ООО "Центральный институт комплексного проектирования жилых и общественных зданий"